面临如此之理论困境，如果没有更深层的理论支持，“质测即藏通几”之说实难成立。那么，方以智如何解决这种困境而达到融合这两种不同之天（“静天”与“於穆不已之天”）的目的呢？
2.“心不用而用小心”——“质测即藏通几”成立的理论基础
针对“质测”与“通几”这两种完全不同的学问，方以智预设了两种不同的心，即“公心”与“独心”。关于“独心”，他有时也称之为“小心”、“心包络”或“生灭心”，这是一种经验的认知之心、可量之心，“静天”相对此心而立，“质测”之学赖以实现；“公心”或曰“先天之心”、“不生灭心”，它是道德本心，它是以“仁”为内涵的超越之心，是无限之心，“於穆不已”之天即待此心以显，“通几”之学赖以成立。
从本体上说，“公心”与於穆不已之“贯几”以及“公性”同为一体，“几”就是道德本心，这在第一章已讲过，兹不赘述。方以智说：“以几橐籥于人心，心尽自知之，岂得窃恃大帱，而颟顸於穆之一觉哉？”[110]这里的“人心”是相对动物不能“尽心”、不能“弘道”、不能识“几”而言，只有“人心”才可扩充而至其极，才可呼为“公心”。寂感之“几”无处不贯，人但尽心，自能见性知“几”，不累于物。胡五峰说：“知几，则物不能累而祸不能侵。”[111]不累于物，是因为与万物同体，上达天德，孟子曰：“尽其心者，知其性也。知其性，则知天矣。”（《孟子·尽心上》）此“天”即是方以智所说的具有生生之德的“於穆不已”之“天道”，或曰“寂感之几”，而不是西学以认知之心所对待的“静天”。“静天”无所谓“生生之德”，只有“於穆不已之天”才可说“天地之大德曰生”（《周易·系辞下》），此天是道德修养所契合的目标。这种道德之心由工夫见，“它本身是一种存在，不是由推理而得的，故可以不与科学发生纠缠”[112]。“公心”说并非始于方以智，不过，将“公心”与“独心”对言，使其分别对治“通几”和“质测”的做法，在中国思想史上却是首次。